NGS 샘플 조건

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샘플 요구 조건
CRITERIADNARNALIBRARY
ConditionWithout degradation and RNA contaminationWithout degradation and DNA contaminationIndex information required
Minimum Quantity1μg1μgVol 20μl
Minimum concentration50ng/μl65ng/μl10ng/μl 10nmol
PurityOD260/280 = 1.5~2.2RIN ≥ 6.0If possible, Bioanalyzer result would be the best
FFPE RequirementMinimum Surface area = 25mm2
Minimum sample depth = 40microns
Minimum sample volume = 1mm3
Minimum Nucleated cellularity = 80%
Minimum tumor content = 20%
서비스 진행 과정

01

프로젝트 실험 / 분석디자인 논의

샘플 특성, 라이브러리 kit, 플랫폼, 데이터 생산량, 분석 관련 사항

02

샘플 전달

gDNA의 경우 택배, RNA의 경우 직접 방문, 픽업 혹은 퀵 이용 가능

03

샘플 QC

샘플 QC를 통해 양, 농도, 비율, 변성(degradation) 여부 등 상태 확인

04

NGS / 생정보 분석

샘플 특성, 라이브러리 kit, 플랫폼, 데이터 생산량
분석 관련 사항

05

데이터 전달

FTP 서버 링크 또는 외장 하드디스크를 통해 해당 샘플의 원 자료(Raw data) 및 분석 결과를 발송

DNA / RNA 샘플 배송 안내
DNA 샘플 : 1ug (50ng/ul), OD260/280 = 1.6~2.0
RNA 샘플 : 1ug (65ng/ul), RIN value > 6.0
토탈오믹스 샘플 시트
Step 1 : 진행한 QC 결과가 있으면 주문서 상의 샘플 시트(Sample sheet)에 샘플 정보를 기입합니다.
Step 2 : 배송 전까지 -80°C의 온도로 초저온냉동고(deepfreezer)에 보관합니다.
NGS 토탈오믹스 샘플 시트 다운로드
샘플 포장
01
1.5ml 튜브(tube)를 파라필름(para film)으로 잘 감싸서(sealing) 샘플이 증발되는 것을 방지합니다.
02
샘플시트와 라벨링한 샘플 튜브를 지퍼백에 동봉합니다.
03
샘플을 포장합니다. 상자의 두께는 최소 3.8cm가 되도록 포장합니다.
04
샘플이 드라이아이스에 충분히 둘러싸이도록 합니다.
05
비닐 봉투를 잘 묶어 밀봉합니다. (여름에는 비닐 봉지가 터질 우려가 있으므로 너무 꽉 묶지 않도록 합니다)
06
비닐 봉투와 상자 사이의 공간을 신문지 등의 완충재로 채운 다음, 상자를 테이프로 밀봉합니다.
결제 안내
기본 정책: 데이터 생산 단계에서 전체 금액의 50%를, NGS 분석 결과 발송으로부터 1개월 내에 나머지 50% 를 결제합니다.
선택사항: 라이브러리 제작 전에 전체 금액을 일괄 결제 가능합니다.
* 결재방식
1. 세금계산서
2. 신용카드
송금 시에는 아래의 계좌로 이체해 주시면 됩니다.
계좌번호: 120-147607-04-016
은행명: 기업은행
계좌명: Theragen Etex Bio Institute
배송지 주소
(주) 테라젠이텍스 바이오연구소
경기도 수원시 영통구 광교로145 (지번주소:이의동 864-1), 차세대융합기술연구원 A동 4층 (우) 443-270
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전화: 031-888-9444
이메일: totalomics@theragenetex.com