NGS


전장 유전체 시퀀싱은 유전체 전체를 한 번에 읽고 분석하는 것으로, 유전적 변이에 대해 가장 종합적인 정보를 제공할 수 있습니다. 테라젠이텍스 바이오연구소는 국내 최초로 인간 게놈지도를 완성하고, 고래, 호랑이 등 다양한 동식물의 유전자 해독에도 성공한 바 있습니다.

서비스 개요

WGRS
  • SNV/Indels
  • Structure Variantion
  • Copy Number Variantion
  • Trio Analysis
WG de novo
  • Genome Assembly
  • Genome Annotation

Main Capture Kit

  • TruSeq Nano DNA Sample Prep Kit
  • Nextra Mate Pair Sample Prep Kit

시퀀싱 플랫폼

HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / NovaSeq 6000
엑솜(Exome) 영역은 전체 유전체의 1%(30Mb)에 불과되지만 생물학적 기능에 있어서는 매우 중요합니다. 엑솜 시퀀싱은 엑솜 영역만을 선택적으로 확인하는 기술로 전장 유전체 시퀀싱에 비해 매우 경제적입니다. 암 및 습관성 질환 관련 유전자 발굴에 효과적으로 적용할 수 있기 때문에 임상연구에 주로 사용되고 있습니다.

서비스 개요

  • SNV/Indels
  • Copy Number Variantion
  • Trio Analysis

Main Capture Kit

  • SureSelect XT All Exon V5 Kit
  • SureSelect XT All Exon V6 Kit
  • SureSelect XT custom Teir 1

시퀀싱 플랫폼

HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / NovaSeq 6000
전사체 시퀀싱을 통해서는 각 샘플 간 전사체 발현 값의 차이를 확인할 수 있습니다.
모든 생명체는 자신의 유전 정보를 토대로 단백질을 만들어내기 위해서 유전자 DNA 서열을 mRNA라고 하는 중간 매개체로 전사(transcription)하는 과정을 거쳐야 합니다. 이러한 mRNA를 분석한다면 특정 시점에서 활성화된 유전자 정보를 파악할 수 있습니다.

서비스 개요

Reference Based
  • Gene Expression
  • DEG
  • Splicing Variants
  • Gene Fusions
de novo Based
  • Transcript Assembly
  • Gene Expression
  • DEG
Small-RNA Seq
  • miRNA Expression
  • Identification of miRNA
  • Target Prediction

Main Capture Kit

  • TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit
  • TruSeq Stranded Total RNA Sample Prep Kit
  • NEXTflex Small RNA-Seq Kit v3

시퀀싱 플랫폼

HiSeq 2500 / HiSeq 4000 / NovaSeq 6000
Single-cell transcriptome sequencing identifies diversity among cells and can be applied to various research fields such as screening of cell therapy products, stem cell research, development of anticancer drugs, and basic research on structure development.
The single cells produced with NGS technology have a combination of characteristics of existing data and characteristics derived from amplification skill, and various procedures and methods need to be used to analyze the data.
If single cells are used, various biological interpretations are possible through analyses within cell types, between cell types, and between tissues, which are obtained by clustering analysis of transcriptome genome data.

Service overview

  • Gene Expression
  • Cell Type Signature
  • Tumor Heterogeneity
  • Tumor Microenvironment
  • Single Cell Immune Profiling

Main Capture Kit

Nextera DNA Library Prep Kit

Sequencing Platform

HiSeq 4000 / NovaSeq 6000
원하는 영역만을 확인할 수 있도록 별도 주문 제작된 키트를 사용해 선택적으로 분석하는 방법입니다.

서비스 개요

SNV/Indels

Main Capture Kit

Customized Capture Kit
메타지놈 시퀀싱은 특정 자연환경에 존재하는 모든 미생물의 유전체 집합을 확인하는 방법입니다. 환경 시료로부터의 미생물 군집 유전체 프로파일링(profiling) 및 기능적 유의성 확인, 다른 환경 시료와의 미생물 군집 패턴 차이 확인 등이 가능합니다. 이 분석 기법은 최근 인체의 장 혹은 구강 내에 존재하는 미생물의 군집 패턴이 질병과의 연관성이 있다는 보고가 증가하는 추세여서, 향후 의학 분야에서도 다양하게 이용될 것으로 전망됩니다.

서비스 개요

  • 16s rRNA gene PCR
  • Taxonomy Profiling
  • Calculation of OTU
  • Whole Metagenome
  • Whole Metagenome Assembly
  • Taxonomy Profiling
  • Functional Annotation

Main Capture Kit

  • Nextera XT Index Kit
  • TruSeq Nano DNA Sample Prep Kit

시퀀싱 플랫폼

MiSeq / HiSeq X / NovaSeq 6000